Материал: Biokhimia_v_risunkakh

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

II. Репарация

Передача генетической информации в неискаженном виде - важнейшее условие сохранения вида. Это обеспечивается за счет комплементарности. Однако, возможны как ошибки репликации, так и неблагоприятное действие окружающей среды (радиация, УФ-облучение, химические агенты).

Cуществует специальная система мониторинга точности спаривания нуклеотидов, причем осуществляется двойная проверка:

-при включении ДРН в растущую цепь;

-после включения ДРН путем удаления ошибочных нуклеотидов (ошибки происходят

не чаще, чем 1 раз на 10 пар оснований).

Причины спонтанных нарушений

ошибки репликации

депуринизация вследствие непрочности N-гликозидной связи в пуринах дезаминирование (Ц У, А Г, Г Х)

Причины индуцированных нарушений

алкилирование азотистых оснований (алкилирующие агенты применяются как ингибиторы новообразований)

образованиесшивок - пиримидиновых димеров между соседними основаниями (тимином) под действием УФ-облучения

сахаро-фосфатный

ДНК

остов

пары оснований,

 

 

связанные

водородными

связями

повреждение

удаление поврежденного участка

ДНК-полимераза I строит новую копию

ДНК-лигаза сшивает разрыв

Репарация – удаление поврежденных участков ДНК или ошибочно встроенных нуклеотидов. Ключевой частью всех репаративных систем является распознавание дефекта в структуре ДНК, который или сразу восстанавливается, или маркируется специальными белками.

Этапы репарации:

1) узнавание места повреждения и раскручивание участка ДНК в области повреждения 2) однонитевой разрыв ДНК с 5 –конца на

расстоянии около 20 п.о. от места повреждения

УФ-специфической эндонуклеазой

3) достройка (“латка”) поврежденной цепи с помощью ДНК-полимеразы 1

4)отщепление поврежденного участка за счет экзонуклеазной активности ДНК-полимеразы I

5)сшивание 3-конца латки с 5-концом

основной цепи ДНК-лигазой

130

В клетке действует несколько систем репарации, позволяющих сохранить генетическую информацию. Нарушение работы таких систем приводит к заболеваниям, например, к пигментной ксеродермии – аутосомно-рецессивному наследственному заболеванию. Существует две основные клинические формы проявления этого заболевания: одна сопровождается дегенеративными изменениями в глазах и коже, а другая, кроме того, характеризуется неврологической дегенерацией. Тяжелым осложнением этого заболевания является рак кожи. Причины развития пигментной ксеродермии связывают с дефектами ферментов репарации

тиминовых димеров

(в частности, нарушение синтеза

УФ-специфичной

эндонуклеазы).

 

 

 

III. Генные мутации

 

Изменения генетической программы ДНК клеток называются мутациями. Различают хромосомные мутации (изменение числа хромосом, хромосомные абберации) и молекулярные или генные мутации.

Генные мутации - это наследуемые изменения первичной структуры ДНК, которые ведут либо к прекращению синтеза белка, либо к синтезу измененного, дефектного белка.

Мутации в регуляторных участках оперона ведут к нарушению регуляции или прекращению синтеза ДНК.

Существуют следующие варианты генных мутаций: Транзиция - замена пар оснований

Миссенс-мутация - приводит к изменению смысла кодона при замене нуклеотида, а, значит, к синтезу измененного белка. Например, серповидноклеточная анемия: кодон, отвечающий за включение глу в цепь гемоглобина, превращается в кодон вал.

Замена одного нуклеотида не всегда ведет к изменению смысла кодона (т.к. код вырожденный) - такое изменение ДНК фенотипически не проявляется.

Нонсенс-мутация - в результате замены образуется один из терминирующих кодонов, при этом синтез белка прекращается и образуется незавершенный белок.

Делеция - выпадение одной пары или групп оснований

Вставка одной пары или групп оснований. Эти мутации могут быть как с изменением рамки считывания (выпадение или вставка одного или двух нуклеотидов), что ведет к синтезу бессмысленного белка, так и без изменения рамки считывания (три нуклеотида) - синтезируется белок, укороченный на 1 аминокислоту.

Изменение местоположения отдельных участков ДНК.

131

IV. Молекулярные основы транскрипции

Транскрипция - это синтез всех видов РНК по матрице ДНК, осуществляемый ферментом ДНК-зависимой РНК-полимеразой.

Молекула ДНК, хранящая генетическую информацию, непосредственного участия в синтезе белка не принимает. Возможно лишь снятие с нее копий, которые отправляются в цитоплазму, доставляя генетическую информацию к рибосомам – месту биосинтеза белка.

Каждая такая копия

– послание ( message, англ.) –

представляет собой

м-РНК. Таким образом,

информация, записанная в последовательности нуклеотидов ДНК копируются (транскрибируются) в виде м-РНК с последующей трансляцией в полипептидную цепь белка. Транскрипция – это первый этап в экспрессии генов.

Экспрессия генов:

транскрипциятрансляция

ДНК&

РНК&

белок&

 

Суммарное уравнение транскрипции:

kАТФ

ДНК-матрица

АМФk

l ГТФ

РНК-полимеразы

РНК ГМФl + (k+l+n+m) ФФ

n ЦТФ

ЦМФn

mУТФ

 

УМФm

Осуществляется транскрипция с помощью

ДНК-зависимых РНК-полимераз , для

работы которых необходимы: матрица – двуцепочечная ДНК, субстраты - АТФ, ГТФ, УТФ, ЦТФ (они же используются как источники энергии), ионы магния.

Упрокариот РНК-полимераза

состоит из

4 субъединиц,

образующих

кор-фермент

(“сердцевина”), к которому

присоединяется дополнительный

белковый

σ-фактор,

способствующий более прочному связыванию фермента со специфической промоторной последовательностью на матрице ДНК.

Эукариотические клетки обычно содержат 3 типа РНК-полимераз:

РНК-полимераза I катализирует синтез рибосомальной (рРНК);

РНК-полимераза II катализирует синтез пре-мРНК - ингибируется токсином бледной поганки α-аманитином;

РНК-полимераза III катализирует синтез трпнспортной (тРНК). 132

РНК синтезируется комплементарно и антипараллельно транскрибируемой цепи ДНК. Рост цепи РНК идет только в направлении 5' 3'. Для начала синтеза РНК фермент не нуждается в полиили олигонуклеотидной затравке. Цепь ДНК, на которой идет транскрипция, называется кодирующей, другая - некодирующей.

Принципы транскрипции:

Отличия ферментов транскрипции и репликации

комплементарность.

РНК-полимераза не нуждается в праймере

антипараллельность.

РНК-полимераза сама расплетает материнскую цепь

униполярность.

РНК-полимераза не обладает нуклеазной активностью

беззатравочность.

РНК-полимераза перемещается по матрице значительно

асимметричность.

медленнее, чем ДНК-полимераза

 

 

 

РНК-полимераз в клетке значительно больше, чем

 

 

ДНК-полимераз

 

Синтез РНК начинается в особых участках ДНК, называемых

промоторами, а

заканчиваются в терминаторах. Участок ДНК, ограниченный промотором и терминатором, называется транскриптон (эукариоты) или оперон (прокариоты). Он включает гены или структурные цистроны, которые несут информацию о структуре полипептидных цепей или нематричных РНК. Транскриптон может содержать один структурный ген или несколько.

Структура оперона

Промотор - участок оперона, служащий для узнавания ферментом РНК-полимеразой. Последовательность оснований по ходу цепи ДНК ниже сайта промотора с направлением 3’ 5’ используется в качестве матрицы для синтеза РНК.

Промоторы прокариот –представляют собой последовательность, состоящую из ~40 нуклеотидов. Узнавание и прочное связывание с РНК-полимеразой происходит на разных участках ДНК. Эти участки отличаются и по первичной, и по вторичной структуре. Путем секвенирования выявили структуру многих промоторов. У

большинства из них имеется общее свойство.

133

РНК-полимераза узнает промотор,

покрывая

40-60 пар нуклеотидов. В

промоторе узнается взаимное

расположение двух

AT-богатых

участков. В каждом из них

4-6 пар

нуклеотидов. Центры этих участков

находятся в

положениях "-10" и "-35".

Принципиально важным является расстояние между этими участками. Оно колеблется от 16 до 19 п.н. Искусственное увеличение этого расстояния до 20 п.н. или уменьшение его до 15 п.н. приводит к тому, что РНКполимераза не узнает испорченный промотор.

Для связывания G-фактора РНК-полимеразы с ДНК (сайт инициации) служит « - 35 последовательность» из 6 нуклеотидов, а расплетение двух цепей ДНК происходит в «Pribnowbox», т.е. – «- 10 последовательности». В этих участках много пар А::::Т, между которыми только две водородные связи, поэтому цепи ДНК легко расходятся («плавятся»).

Промоторы эукариот содержат участки, которые не только указывают место начала транскрипции, но и базовую частоту этого процесса.

Большинство генов эукариот содержит в своем промоторном участке специфические последовательности матричной ДНК, которые усиливают (энхансеры) или ослабляют (сайленсеры) уровень экспрессии соответствующих структурных генов, влияя на активность транскрипции, т.е. на количество синтезируемых молекул мРНК и на скорость их образования.

Энхансеры могут повышать эффективность транскрипции генов, на которые они влияют, в десятки и сотни раз. Установлены нуклеотидные последовательности энхансеров для ряда ферментов (алкогольдегидрогеназы, химотрипсина), гормонов (инсулина), иммуноглобулинов.

Для транскрипции требуется не только РНК-полимераза, но и другие белки – основные факторы транскрипции. У эукариот таким фактором является ТАТА-связывающий белок, который взаимодействует с ТАТА-последовательностью (ТАТА-боксом). В этот

комплекс встраивается РНК-полимераза и другие

основные факторы транскрипции.

Главная задача такого комплекса – «распаковать»

нуклеосому, а кроме того создать

условия сорбции

специфических факторов транскрипции

, которые могут

активироваться после взаимодействия с определенными веществами, напрмер, гормонами.

134

Источник: https://studfile.net/preview/16440813/