Материал: POYaSNI_ZA_BKh_ChTO-TO_PO_BKh-1

Для того, чтобы знать, сколько АТФ получится из конкретной аминокислоты, нужно знать, сколько у неё атомов углерода и на каком этапе цикла она может встроиться.

Схема примерно такая:

Здесь стоит отметить, что при переходе пирувата в оксалоацетат восстанавливается одна молекула НАДН, то есть получаем ещё 2,5 АТФ. Затем цикл прогоняется (+10 АТФ) и получается 12,5 АТФ из аланина, например.

21

Если мы возьмём гистидин, пролин или любую аминокислоту, которая встраивается посреди цикла, то нужно воспроизвести на бумаге или в голове все реакции до оксалоацетата, посмотреть, сколько энергии получилось, а затем прибавить ещё один прогон цикла (+10 АТФ), потому что оксалоацетат нужно расщепить до конца.

Если посмотреть на цикл Кребса с чисто физической точки зрения, то не вся энергия переходит в АТФ. Какаято часть энергии выделяется в виде теплоты. Но полезная запасённая энергия или коэффициент полезного действия равен 65%. Это больше, чем КПД бензинового ревущего монстра тонированной девятки, но меньше, чем КПД электрокаров Илона Маска.

Можно подумать, что природа такая глупая, что не может экономить энергию. Однако, цикл Кребса выполняет ещё одну функцию – его промежуточные вещества могут превращаться в аминокислоты, глюкозу и жирные кислоты по необходимости. Как тебе такое, Илон Маск?

22

Дыхательная цепь

Сразу поясню за НАД и ФАД.

Эти коферменты несут на себе атомы водорода, которые они могут отдавать с получением энергии. Цех по получению энергии из водорода называется дыхательной цепью. Она расположена в мембране митохондрии и состоит из цепочки ферментов. Первый фермент забирает водород у НАДН или ФАДН2, а затем электрон водорода катается по цепочке, теряя энергию, которая идёт на выкачивание протонов из митохондрии наружу. По градиенту концентрации протоны стремятся обратно внутрь, но пройти они могут только через АТФсинтетазу, которая использует энергию проскакивания протона внутрь на превращение АДФ в АТФ. Электроны в конечном итоге забираются кислородом, делая его атомарным. Атомарный кислород тут же хватает пару ближайших протонов, превращаясь в воду.

В целом получается, что НАДН окисляется, а АДФ фосфорилируется, поэтому всё вместе это называется окислительным фосфорилированием.

Ферменты этой цепи называются цитохромами, у них есть свои буквенные обозначения (а, b, c), но суть в том, что они расположены последовательно и каждый следующий любит электроны сильнее предыдущего. Ферменты собраны в комплексы. Комплекс I забирает водород у НАДН, комплекс II забирает водород у ФАДН2.

23

Далее через коэнзим Q электроны передаются на III комплекс, а далее на IV.

24

Удаление карбоксильной группы

Это второй путь превращений аминокислот (первый – забрасывание в котёл). Если от аминокислоты отщипнуть её кислотный центр, то можно получить разные полезные штуки, о существовании которых ты знал, скорее всего, раньше. Теперь будешь знать, откуда они берутся. Фермент, который участвует в этом пути – декарбоксилаза (почти для каждой аминокислоты своя).

На картинке ниже видно, как образуется стимулятор гладких мышц и тормозной медиатор – серотонин. Реакция проходит в два этапа. В первом этапе фермент триптофангидроксилаза вешает гидроксильную группу на триптофан. Кофермент биоптерин отдаёт два атома водорода для образования воды. На втором этапе декарбоксилаза отщепляет карбоксильную группу и получается серотонин. Стрелочки вниз намекают на возможность превращения серотонина в мелатонин (гормон сна).

25