Одна из биологически важных реакций – отщепление аминогруппы в виде аммиака (NH3). Это реакция дезаминирования, а аммиак – конечный продукт обмена и очень токсичен, так как является сильным основанием. Существует два типа дезаминирования.
В организме (in vivo) протекает окислительное дезаминирование в присутствии кислорода, с участием кофермента НАД+ и образованием кетокислот и аммиака.
|
|
NAD |
+ |
|
|
HOH |
|
|
|
||
R- |
CH-COOH |
R-C-COOH |
R-C-COOH |
||||||||
|
|
||||||||||
_ 2 H |
_ NH |
3 |
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
NH2 |
|
NH |
|
O |
|||||||
|
|
|
|||||||||
amino acid |
|
imino acid |
|
|
oxo acid |
||||||
аминокислота |
|
иминокислота |
|
|
кетокислота |
||||||
В спорах, грибах протекает неокислительное дезаминирование без участи кислорода и образованием α, β – ненасыщенных кислот
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
фермент |
|
|
|
|
|
|
|||
HOOC |
|
CH2 |
|
CH |
|
|
|
|
|
|
COOH |
|
HOOC |
|
CH |
|
CH |
|
COOH + |
NH3 |
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||
аспарагиновая кислота |
|
фумаровая кислота |
|
|
|||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HOOC |
|
|
H |
|
|
|||
HOOC-CH |
|
|
|
CH-COOH |
|
|
|
H |
C=C |
+ |
NH3 |
||||||||||||
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
COOH |
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
H |
NH2 |
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||
|
|
aspartic acid |
|
|
fumaric acid |
|
|
||||||||||||||||
Аспарагиновая кислота |
|
фумаровая кислота |
|
|
|||||||||||||||||||
4.Химические модификации
Окисление тиогрупп в организме (in vivo). Например, а/к цистеин,
как тиол, легко окисляется в дисульфид, реакция обратима. Способность SH-групп легко окисляться выполняет защитную функцию при облучении, лучевой болезни, радиации.
|
CH2- |
|
CH-COOH |
|
|
CH2- |
|
CH-COOH |
||||||
|
|
|
|
|||||||||||
|
|
|
|
|
|
[O] |
|
|
|
|
|
|
|
|
SH |
|
|
|
|
S NH |
|||||||||
NH2 |
||||||||||||||
|
2 |
|||||||||||||
+ SH |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
[H] |
S |
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
CH2-CH-COOH |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
CH2- |
|
CH-COOH |
||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
NH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
NH2 |
||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
Цистеин |
цистин |
||||||||||||
Реакции карбоксилирования – это введение карбоксильной группы,. Можно рассмотреть на примере образования белка тромбина из белка протромбина, реакция протекает с участием витамина К, СО2 и иона кальция. Эта реакция имеет значение для процесса свертывания крови.
|
|
_ |
vit K |
|
|
|
COO |
Ca |
+2 |
||
|
|
|
|
|
|
||||||
proteine |
|
proteine |
|
CH2-CH2 |
|
|
|||||
|
CH2-CH2-COO |
|
|
_ |
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|||||||
|
|
|
|
|
|
|
|||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
COO |
|
|
|
|
proteine |
|
|
COO |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
CH2-CH2 |
Ca |
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
thrombus |
COO |
|
|
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||
Тромб
5.Реакции гидроксилирования – это введение гидроксильной группы в молекулу аминокислоты. Например, гидроксилирование фенилаланина протекает с участием кислорода, восстановленной формы кофермента НАДФ и протона. Это синтез незаменимой аминокислотытирозина.
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
+ |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
|
H2C |
|
|
CH |
|
COOH |
O2, NADFH,H |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
HO |
|
|
|
H2C |
|
|
CH |
|
COOH |
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH2 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
NH |
2 |
|
|||||||
phenylalanyne |
|
tyrozine |
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||
фенилаланин |
тирозин |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||
При гидроксилировании лизина образуется оксилизин, при гидроксилировании пролина с участием витамина С – оксипролин, обе кислоты участвуют в синтезе коллагена, белка соединительной ткани. При недостатке витамина С коллаген не синтезируется и развивается цинга.
HO
COOH аскорбиновая кислота
4 3
5 2 COOH
1
NH |
NH |
пролин |
4 - гидроксипролин |
Принципиальный путь синтеза катехоламинов (дофамина, норадреналина, адреналина).
При патологии синтез адреналина может блокироваться и накапливается фенилпировиноградная кислота, развивается тяжелое наследственное заболевание – фенилкетонурия.
6.Специфические реакции α, β, γ- аминокислот.
Для α, β, γ- аминокислот характерны такие же реакции, как и для α, β, γ- гидроксикислот. Так как аминокислоты содержат две различные удаленные функциональные группы, то между ними возможно взаимодействие с образованием циклических продуктов. Особенно легко протекает внутримолекулярная циклизация, когда она приводит к устойчивым 5-ти или 6-тичленным циклам. Например при циклизации γ-аминомасляной кислоты образуется циклический амид, который называется лактам.
H2C |
|
CH2 |
|
CH2 |
|
O |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
OH |
|
|
|
|
|
O |
|||
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
NH2 |
|
|
N |
|||||||||
|
|
|
||||||||||
|
|
|
H |
|||||||||
γ-аминомасляной кислоты |
|
|
γ-аминобутиролактам |
|||||||||
Для него характерна лактам-лактимная таутомерия – это динамическое равновесие между лактамной и лактимной формами
|
O |
OH |
N |
|
|
|
N |
|
H |
|
|
|
|
|
Лактам |
|
лактим |
Для α-аминокислот характерна межмолекулярная циклизация, для β- аминокислот – внутримолекулярная дегидратация (элиминирование) с образованием α, β-ненасыщенных карбоновых кислот.
7.Синтез пептидов. Пептиды и белки – это соединения, построенные из остатков α - аминокислот. Пептиды содержат в молекуле до 100 α – аминокислотных остатков, а белки - свыше 100 α – аминокислотных остатков (что соответствует молекулярной массе больше 10 000 единиц). Пептид – это продукт реакции поликонденсации α – аминокислот, протекающей с образованием пептидной связи между мономерными звеньями. Пептидная связь по своей химической природе является амидной связью (CONH). Предыдущая (первая) α – аминокислота участвует в
образовании связи своей карбоксильной группой (COOH), а последующая – аминогруппой (NH2).
H2N |
|
|
CH |
|
|
COOH + HNH |
|
CH |
|
|
COOH |
H2N |
|
|
|
CH |
|
CONH |
|
|
|
CH |
|
CO OH + |
|||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||||||||||||||
|
|
R |
|
R |
|
|
|
|
|
R |
|
|
|
|
|
|
|
|
R |
||||||||||||||||||||||
+ H NH |
|
|
CH |
|
COOH |
|
H2N |
|
|
CH |
|
CONH |
|
CH |
|
CONH |
|
CH |
|
COOH |
|||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
R |
|
|
|
|
|
|
R |
|
R |
|
|
|
|
|
|
|
R |
||||||||||||||||||
Пептидная цепь имеет линейное строение и состоит из чередующихся амидных (CONH) и метиновых групп. Один конец цепи, на котором находится аминокислота со свободной аминогруппой (NH2), называется N- конец, другой, котором находится аминокислота со свободной (COOH), называется С-конец. Боковые радикалы аминокислот не входят в состав цепочки. Трипептид
|
|
|
|
O |
O |
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
H2N |
|
|
CH |
|
C |
|
N |
|
|
CH |
|
C |
|
N |
|
|
CH |
|
COOH |
||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
H |
|
|
|
|
|
H |
|
||||||
|
R1 |
|
|
|
|
|
|
R2 |
|
|
|
|
|
|
R3 |
||||||
N-конец |
|
|
|
peptide bonds |
|
|
|
|
|
|
С-конец |
||||||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|||||
Пептидная связь
Строение пептидной группы.
В пептидной группе –CONH- атом углерода находится в sp2- гибридизации. Неподеленная электронная пара атома азота вступает в сопряжение с -электронами карбонильной группы. Все это обуславливает плоское строение группы. Атоы C, O, и N, образующие сопряженную систему, находятся в одной плоскости.
H R 0,132 нм
C N
C C
|
|
|
|
0,124 нм O |
R |
||
В результате сопряжения происходит некоторое выравнивание длин связей: двойная связь C=O удлиняется до 0,124 нм (0,121 нм), а связь C-N становится короче – 0,132 нм (0,147 нм). Наличие плоской сопряженной системы в пептидной группе является причиной затруднения вращения вокруг связи C=O. Таким образом, электронное строение предопределяет достаточно жесткую плоскую структуру пептидной группы, благодаря чему