Материал: Лекция Аминокислоты, белки

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

Одна из биологически важных реакций – отщепление аминогруппы в виде аммиака (NH3). Это реакция дезаминирования, а аммиак – конечный продукт обмена и очень токсичен, так как является сильным основанием. Существует два типа дезаминирования.

В организме (in vivo) протекает окислительное дезаминирование в присутствии кислорода, с участием кофермента НАД+ и образованием кетокислот и аммиака.

 

 

NAD

+

 

 

HOH

 

 

 

R-

CH-COOH

R-C-COOH

R-C-COOH

 

 

_ 2 H

_ NH

3

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

NH

 

O

 

 

 

amino acid

 

imino acid

 

 

oxo acid

аминокислота

 

иминокислота

 

 

кетокислота

В спорах, грибах протекает неокислительное дезаминирование без участи кислорода и образованием α, β – ненасыщенных кислот

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

фермент

 

 

 

 

 

 

HOOC

 

CH2

 

CH

 

 

 

 

 

 

COOH

 

HOOC

 

CH

 

CH

 

COOH +

NH3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

аспарагиновая кислота

 

фумаровая кислота

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

HOOC

 

 

H

 

 

HOOC-CH

 

 

 

CH-COOH

 

 

 

H

C=C

+

NH3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

aspartic acid

 

 

fumaric acid

 

 

Аспарагиновая кислота

 

фумаровая кислота

 

 

4.Химические модификации

Окисление тиогрупп в организме (in vivo). Например, а/к цистеин,

как тиол, легко окисляется в дисульфид, реакция обратима. Способность SH-групп легко окисляться выполняет защитную функцию при облучении, лучевой болезни, радиации.

 

CH2-

 

CH-COOH

 

 

CH2-

 

CH-COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

[O]

 

 

 

 

 

 

 

SH

 

 

 

 

S NH

NH2

 

2

+ SH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

[H]

S

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2-CH-COOH

 

 

 

 

 

 

 

CH2-

 

CH-COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Цистеин

цистин

Реакции карбоксилирования – это введение карбоксильной группы,. Можно рассмотреть на примере образования белка тромбина из белка протромбина, реакция протекает с участием витамина К, СО2 и иона кальция. Эта реакция имеет значение для процесса свертывания крови.

 

 

_

vit K

 

 

 

COO

Ca

+2

 

 

 

 

 

 

proteine

 

proteine

 

CH2-CH2

 

 

 

CH2-CH2-COO

 

 

_

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

COO

 

 

 

 

proteine

 

 

COO

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2-CH2

Ca

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

thrombus

COO

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Тромб

5.Реакции гидроксилирования – это введение гидроксильной группы в молекулу аминокислоты. Например, гидроксилирование фенилаланина протекает с участием кислорода, восстановленной формы кофермента НАДФ и протона. Это синтез незаменимой аминокислотытирозина.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

+

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H2C

 

 

CH

 

COOH

O2, NADFH,H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

HO

 

 

 

H2C

 

 

CH

 

COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH

2

 

phenylalanyne

 

tyrozine

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

фенилаланин

тирозин

 

 

 

 

 

 

 

При гидроксилировании лизина образуется оксилизин, при гидроксилировании пролина с участием витамина С – оксипролин, обе кислоты участвуют в синтезе коллагена, белка соединительной ткани. При недостатке витамина С коллаген не синтезируется и развивается цинга.

HO

COOH аскорбиновая кислота

4 3

5 2 COOH

1

NH

NH

пролин

4 - гидроксипролин

Принципиальный путь синтеза катехоламинов (дофамина, норадреналина, адреналина).

При патологии синтез адреналина может блокироваться и накапливается фенилпировиноградная кислота, развивается тяжелое наследственное заболевание – фенилкетонурия.

6.Специфические реакции α, β, γ- аминокислот.

Для α, β, γ- аминокислот характерны такие же реакции, как и для α, β, γ- гидроксикислот. Так как аминокислоты содержат две различные удаленные функциональные группы, то между ними возможно взаимодействие с образованием циклических продуктов. Особенно легко протекает внутримолекулярная циклизация, когда она приводит к устойчивым 5-ти или 6-тичленным циклам. Например при циклизации γ-аминомасляной кислоты образуется циклический амид, который называется лактам.

H2C

 

CH2

 

CH2

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

OH

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

N

 

 

 

 

 

 

H

γ-аминомасляной кислоты

 

 

γ-аминобутиролактам

Для него характерна лактам-лактимная таутомерия – это динамическое равновесие между лактамной и лактимной формами

 

O

OH

N

 

 

N

H

 

 

 

Лактам

 

лактим

Для α-аминокислот характерна межмолекулярная циклизация, для β- аминокислот – внутримолекулярная дегидратация (элиминирование) с образованием α, β-ненасыщенных карбоновых кислот.

7.Синтез пептидов. Пептиды и белки – это соединения, построенные из остатков α - аминокислот. Пептиды содержат в молекуле до 100 α – аминокислотных остатков, а белки - свыше 100 α – аминокислотных остатков (что соответствует молекулярной массе больше 10 000 единиц). Пептид – это продукт реакции поликонденсации α – аминокислот, протекающей с образованием пептидной связи между мономерными звеньями. Пептидная связь по своей химической природе является амидной связью (CONH). Предыдущая (первая) α – аминокислота участвует в

образовании связи своей карбоксильной группой (COOH), а последующая – аминогруппой (NH2).

H2N

 

 

CH

 

 

COOH + HNH

 

CH

 

 

COOH

H2N

 

 

 

CH

 

CONH

 

 

 

CH

 

CO OH +

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R

 

R

 

 

 

 

 

R

 

 

 

 

 

 

 

 

R

+ H NH

 

 

CH

 

COOH

 

H2N

 

 

CH

 

CONH

 

CH

 

CONH

 

CH

 

COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

R

 

 

 

 

 

 

R

 

R

 

 

 

 

 

 

 

R

Пептидная цепь имеет линейное строение и состоит из чередующихся амидных (CONH) и метиновых групп. Один конец цепи, на котором находится аминокислота со свободной аминогруппой (NH2), называется N- конец, другой, котором находится аминокислота со свободной (COOH), называется С-конец. Боковые радикалы аминокислот не входят в состав цепочки. Трипептид

 

 

 

 

O

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H2N

 

 

CH

 

C

 

N

 

 

CH

 

C

 

N

 

 

CH

 

COOH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

H

 

 

R1

 

 

 

 

 

 

R2

 

 

 

 

 

 

R3

N-конец

 

 

 

peptide bonds

 

 

 

 

 

 

С-конец

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Пептидная связь

Строение пептидной группы.

В пептидной группе –CONH- атом углерода находится в sp2- гибридизации. Неподеленная электронная пара атома азота вступает в сопряжение с -электронами карбонильной группы. Все это обуславливает плоское строение группы. Атоы C, O, и N, образующие сопряженную систему, находятся в одной плоскости.

H R 0,132 нм

C N

C C

 

 

 

 

0,124 нм O

R

В результате сопряжения происходит некоторое выравнивание длин связей: двойная связь C=O удлиняется до 0,124 нм (0,121 нм), а связь C-N становится короче – 0,132 нм (0,147 нм). Наличие плоской сопряженной системы в пептидной группе является причиной затруднения вращения вокруг связи C=O. Таким образом, электронное строение предопределяет достаточно жесткую плоскую структуру пептидной группы, благодаря чему

Источник: https://studfile.net/preview/16535912/